Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms