Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms