Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms