Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TM2D3Q9BRN9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms