Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms