Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP88Q99567 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms