Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRAMP1Q96RY5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms