Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms