Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms