Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
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