Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC12Q96J65 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms