Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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