Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms