Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms