Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms