Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCC1Q92922 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms