Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF1Q92879 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms