Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms