Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms