Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT2Q8N9I0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT2Q8N9I0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms