Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3X1

FNBP4, Formin-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNBP4Q8N3X1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNBP4Q8N3X1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FNBP4Q8N3X1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNBP4Q8N3X1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNBP4Q8N3X1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNBP4Q8N3X1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNBP4Q8N3X1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNBP4Q8N3X1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNBP4Q8N3X1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms