Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWDEQ8N2E2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms