Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms