Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms