Protein–RNA interactions for Protein: Q709C8

VPS13C, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 3,753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13CQ709C8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VPS13CQ709C8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VPS13CQ709C8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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VPS13CQ709C8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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VPS13CQ709C8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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VPS13CQ709C8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS13CQ709C8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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