Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms