Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CARMIL1Q5VZK9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms