Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms