Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEXMIFQ5QGS0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEXMIFQ5QGS0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEXMIFQ5QGS0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEXMIFQ5QGS0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEXMIFQ5QGS0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEXMIFQ5QGS0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEXMIFQ5QGS0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEXMIFQ5QGS0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms