Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms