Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK1Q52WX2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms