Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms