Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms