Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms