Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
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