Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMA3Q16787 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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