Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
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