Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms