Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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