Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP10Q15642 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms