Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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