Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCINQ13939 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCINQ13939 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCINQ13939 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCINQ13939 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCINQ13939 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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