Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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