Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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