Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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