Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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