Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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