Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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TRAF2Q12933 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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TRAF2Q12933 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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TRAF2Q12933 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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TRAF2Q12933 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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TRAF2Q12933 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF2Q12933 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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