Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFCP2Q12800 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFCP2Q12800 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFCP2Q12800 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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