Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms